Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
SSPNQ14714 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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