Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU1-56P-201ENST00000391303 164 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC106869.1-202ENST00000441997 604 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 AC061975.3-201ENST00000583209 244 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 HLTF-203ENST00000465259 5306 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 SLC36A3-201ENST00000335230 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 TNPO3-201ENST00000265388 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ATG2B-202ENST00000359933 13684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 KIAA1024-201ENST00000305428 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 CD46-208ENST00000367042 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 LINC02418-202ENST00000567788 4592 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.16
HOXD11P31277 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 CNR1-202ENST00000369499 5549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 IGSF22-205ENST00000513874 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 LINC02312-201ENST00000555187 3046 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ABCA6-201ENST00000284425 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC005332.9-201ENST00000620266 2921 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SLC23A2-201ENST00000338244 6944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PPARA-201ENST00000262735 9965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 SPRR1A-201ENST00000368762 270 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RPS29P14-201ENST00000431518 171 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD11P31277 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD11P31277 OR5AH1P-201ENST00000595968 283 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR6849-201ENST00000618543 69 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 FNDC3A-204ENST00000492622 6286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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HOXD11P31277 ZNF844-201ENST00000439326 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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HOXD11P31277 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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HOXD11P31277 AL353194.1-201ENST00000451507 441 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RN7SL418P-201ENST00000473031 287 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC097462.1-201ENST00000514125 324 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC133485.3-201ENST00000562604 262 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC138907.3-201ENST00000563937 262 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC138869.2-201ENST00000569850 262 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 5S_rRNA.20-201ENST00000612104 118 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 GPR156-201ENST00000315843 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 WDR87-201ENST00000303868 8847 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 OPCML-203ENST00000524381 6424 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
HOXD11P31277 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
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