Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 EPS8-209ENST00000542903 1858 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC073343.1-201ENST00000328239 651 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 U3.32-201ENST00000408116 212 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
RFXAPO00287 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
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