Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1Q9UJ41 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1Q9UJ41 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1Q9UJ41 MIR6721-201ENST00000617181 87 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
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RABGEF1Q9UJ41 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND11-209ENST00000402736 3950 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1Q9UJ41 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
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