Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 FRG1DP-201ENST00000635586 771 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SMG1Q96Q15 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMG1Q96Q15 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms