Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC02293-201ENST00000548335 574 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR4330-201ENST00000579077 105 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
NTRK3Q16288 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
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