Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 NOP56P3-201ENST00000549457 385 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
PDE6HQ13956 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.1
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PDE6HQ13956 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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