Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 FGF7P1-201ENST00000582820 288 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC087283.1-201ENST00000604029 1074 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FHL3Q13643 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.84□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.6 ms