Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SOCS5-201ENST00000306503 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL356289.2-201ENST00000455238 292 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
TOP3AQ13472 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR9G1-202ENST00000642097 3611 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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