Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SNTN-203ENST00000496807 3746 ntTSL 4 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ATP2B4-201ENST00000341360 4658 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RACGAP1P-201ENST00000550663 1879 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 FMN1-211ENST00000561249 4251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC123769.2-201ENST00000624332 5984 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL354707.3-201ENST00000427308 331 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RN7SL70P-201ENST00000478322 302 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RN7SL379P-201ENST00000479912 293 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC005740.3-201ENST00000520882 344 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RPL7AP69-201ENST00000595306 806 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MYLK-206ENST00000418370 7282 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TRPM3-208ENST00000377105 5957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 NACA-203ENST00000454682 6629 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RGPD3-201ENST00000304514 5510 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 OR2T2-202ENST00000641925 3530 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 HTT-201ENST00000355072 13474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 OR10A2-202ENST00000641461 5390 ntAPPRIS P1 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNA5SP172-201ENST00000365061 118 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RPL36P18-201ENST00000419316 318 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LRTOMT-209ENST00000440313 253 ntTSL 3 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL391361.2-203ENST00000443380 413 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RN7SL492P-201ENST00000460700 295 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 KLHL5-205ENST00000508137 2926 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ATF6-201ENST00000367942 7496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.69□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 DCAF13-210ENST00000618975 2038 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 ZNF160-208ENST00000599056 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC7.68□□□□□ -1.18
MKRN4PQ13434 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.6 ms