Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LINC01941-201ENST00000455174 624 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
XRCC4Q13426 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
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