Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
ERCC8Q13216 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
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ERCC8Q13216 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
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