Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
EPHB4P54760 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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