Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC092111.3-201ENST00000402465 496 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 VWC2L-201ENST00000312504 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL121839.2-201ENST00000565058 6943 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 F9-201ENST00000218099 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 AC092747.4-201ENST00000620519 1861 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
ATP9BO43861 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.5 ms