Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PHKA2-AS1-202ENST00000452900 656 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 USP17L23-201ENST00000506619 551 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 KCNJ10-207ENST00000638868 3883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 RFX4-203ENST00000392842 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1Q9UJ41 CNTRL-204ENST00000373847 3372 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1Q9UJ41 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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