Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC022306.3-201ENST00000619930 550 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms