Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC005532.2-201ENST00000467154 373 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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UBXN4Q92575 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
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UBXN4Q92575 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MFSD4BP1-201ENST00000513330 1552 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
UBXN4Q92575 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
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