Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 ORC4-201ENST00000264169 6598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
RPE65Q16518 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms