Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC097374.1-203ENST00000400783 485 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 LINC01675-201ENST00000426519 701 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
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NTRK3Q16288 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AP002512.4-201ENST00000641310 4672 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
NTRK3Q16288 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
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