Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 NFKBIZ-203ENST00000394054 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 C9orf72-203ENST00000380003 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPN12Q05209 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms