Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP3Q9Y6F1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms