Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
LINC00312Q9Y6C7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
LINC00312Q9Y6C7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms