Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I4

PCDHAC2, Protocadherin alpha-C2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHAC2Q9Y5I4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHAC2Q9Y5I4 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCDHAC2Q9Y5I4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms