Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SH3BP1Q9Y3L3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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