Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
KCNIP3Q9Y2W7 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms