Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y240

CLEC11A, C-type lectin domain family 11 member A, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC11AQ9Y240 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AL390728.6-201ENST00000566446 1246 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLEC11AQ9Y240 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CLEC11AQ9Y240 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms