Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IGSF9BQ9UPX0 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms