Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PDZRN3Q9UPQ7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PDZRN3Q9UPQ7 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms