Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
INO80Q9ULG1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
INO80Q9ULG1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms