Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL41

PNMA3, Paraneoplastic antigen Ma3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA3Q9UL41 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PNMA3Q9UL41 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PNMA3Q9UL41 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms