Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
FBXO4Q9UKT5 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FBXO4Q9UKT5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms