Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MRTO4Q9UKD2 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms