Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GGA2Q9UJY4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms