Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN11AQ9UI33 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN11AQ9UI33 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms