Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SFMBT1Q9UHJ3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms