Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CFDP1Q9UEE9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CFDP1Q9UEE9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms