Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MBD2Q9UBB5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms