Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SUCLA2Q9P2R7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SUCLA2Q9P2R7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms