Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
CCDC180Q9P1Z9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC39.25■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC39.23■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC39.2■■■■□ 3.87
CCDC180Q9P1Z9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
CCDC180Q9P1Z9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC39.18■■■■□ 3.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms