Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
VAPAQ9P0L0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VAPAQ9P0L0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms