Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C9orf78Q9NZ63 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms