Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJB4Q9NTQ9 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJB4Q9NTQ9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms