Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GPHNQ9NQX3 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPHNQ9NQX3 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms