Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ0

TNRC6C, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRC6CQ9HCJ0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TNRC6CQ9HCJ0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TNRC6CQ9HCJ0 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms