Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CLSTN2Q9H4D0 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms