Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0E7

USP44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP44Q9H0E7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
USP44Q9H0E7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
USP44Q9H0E7 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms