Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I4

THSD7B, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7B, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7BQ9C0I4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
THSD7BQ9C0I4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms