Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRIM8Q9BZR9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TRIM8Q9BZR9 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms