Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CRNKL1Q9BZJ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CRNKL1Q9BZJ0 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms