Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PUS3Q9BZE2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PUS3Q9BZE2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms